Los analistas coinciden que debido a la funcionalidad y al uso que se le dan a estos pequeños dispositivos sumado a su baja capacidad de procesamiento, que implica que los usuarios avanzados desactiven programas de seguridad para mejorar la velocidad y a la falta de manejo por su parte, podría ser un blanco fácil para que los piratas informáticos hagan de las suyas.
La ferviente moda de los netbooks ha ocasionado que cada vez sean más los fabricantes que dispongan de una gama en sus catálogos y su precio tan bajo implica que los netbooks a menudo carezcan de protección como los "firewalls" u otros programas de seguridad. Por otro lado su uso como un segundo ordenador dedicado exclusivamente para navegar por sitios estratégicos como el correo electrónico o las cuentas bancarias hacen que el peligro aumente.
Samson Hu que dirige muchas de las operaciones de Asustek afirma que por lo menos su compañía incluye en los dispositivos características incorporadas de seguridad y otras opciones suficientes para el usuario típico. "Hemos recibido muy buenos comentarios por parte de los usuarios, pero, por supuesto, todo el mundo debería estar al tanto de los problemas en materia de seguridad en Internet cuando están conectados a una red". A pesar de ello muchas empresas rehuyen de estos pequeños ordenadores por considerar sus datos especialmente importantes como para trasladarlos en su interior.
